해남군은 축산분야 지원금의 공정하고 투명한 집행 관리를 위해 보조금 대상자 선정 및 사후관리 제도를 대폭 강화하기로 했다.
이에따라 사업 사후관리에 중점을 두고 보조사업의 모든 단계에서 부정·부실 사례가 발생하지 않도록 관련 제도를 강화할 계획이다. 
사업자 선정 단계에서는 지원대상의 경영체 정보를 의무적으로 등록·갱신토록 하고 중복편중 지원과 부정수급 등 지원 배제대상 여부를 사전에 검증하는 한편, 지역축산발전 및 기여도 등 축산경영의 의무 성실 이행자를 우선 지원하기로 했다.
지원금 집행·정산 단계에서는 통합관리시스템을 통해 교부·집행·정산하는 전산시스템으로 운영방식을 개편하고 전자세금계산서, 지원사업 카드영수증, 계좌이체 등 거래증빙을 확인해 허위 또는 중복사용 여부 등 실시간 검증토록 했다.
사업 사후관리 단계에서는 사업자의 중요재산 정보등록 관리를 의무화하고 지원사업으로 취득한 물건을 사후관리 기간 내 승인 없이 임의 처분할 수 없으며, 농업보조금 부정수급, 목적 외 사용 등이 확인될 경우 보조금 환수 및 지원제한 등을 강화하기로 했다.